Varje Joy-Con har en komplett set knappar, så den kan ses som en fristående kontroller. Varje Joy-Con inkluderar en accelerometer och rörelsesensor. Den vänstra Joy-Con har en fångstknapp som spelare kan trycka på för att ta skärmdumpar av spel till dela med vänner på sociala nätverk Rätt Joy-Con inkluderar en NFC-sensor som låter dig interagera med amiibo, samt en IR-rörelsekamera som kan upptäcka avståndet, formen och rörelsen av närliggande föremål i specialskapade spel. Detta gör att kontrollern till exempel kan mäta hur långt en spelares hand är. Båda Joy-Cons inkluderar en avancerad HD rumble-funktion, som kan utföra mycket mer realistiska vibrationer än tidigare i kompatibla spel